菌種鑒定手段包括形態(tài)學(xué)觀察、生理生化特性鑒定、 BIOLOG碳源自動分析鑒定、分子生物學(xué)鑒定、API細(xì)菌數(shù)值鑒定、功能性分析及功能基因、RAPD、SSCP、TLC薄層層析、全細(xì)胞脂肪酸分析鑒定、（G＋C）mol％測定、DNA/DNA同源性測定等。

健明迪檢測根據(jù)《中國藥典》2015年版，大多數(shù)非無菌藥品生產(chǎn)過程和部分無菌生產(chǎn)環(huán)境的風(fēng)險評估中，對所檢出微生物需要進(jìn)行常規(guī)特征分析，即可滿足要求。菌種鑒定需要極其縝密的分析儀器及豐富的檢測經(jīng)驗(yàn)，以下是健明迪檢測結(jié)合豐富的菌種鑒定經(jīng)驗(yàn)總結(jié)出的菌種鑒定部分相關(guān)內(nèi)容。

健明迪檢測常用通過DNA測序?qū)ξ⑸镞M(jìn)行物種鑒定（菌種鑒定）是比傳統(tǒng)生化鑒定更先進(jìn)的鑒定方法。DNA測序不依賴菌種本身特點(diǎn)，對所有菌種均可使用，比傳統(tǒng)生化鑒定更加快速、準(zhǔn)確。

細(xì)菌、放線菌、酵母、霉菌、大型絲狀真菌、乳桿菌、雙歧桿菌、腸球菌、芽孢桿菌等
微生物物種鑒定服務(wù)包括：細(xì)菌16s rDNA鑒定和真菌26s rDNA鑒定、真菌ITS和真菌18s鑒定